Науково-дослідницька діяльність безперервно ведеться на кафедрі з дня її заснування. Захист дисертаційних робіт не переривалася навіть в роки евакуації ВНЗ в роки Другої світової війни.
За час свого існування на кафедрі постійно проводилася науково-дослідна робота, яка отримала високу оцінку фахівців. Багато наукові роботи проводилися спільно з організаціями Міністерства морського флоту, Союзморнііпроект, ЦНИИМФ, Чорноморського, Азовського, Дунайського і ін. Пароплавств.
З 2012 по 2015 р при Науково-дослідному інституті фундаментальних і прикладних досліджень співробітниками кафедри, здобувачами, аспірантами, а також студентами велася робота по темі «Організація транспортного процесса та управління роботом флоту на міжнародному Сайти Вся транспортних послуг в условиях глобалізації МІЖНАРОДНОГО судноплавства» (656.61 .07: 629.123.3 + 629.123.4, № держ. реєстрації: 0109U003246). Керівник НДР: д.т.н., проф. А. Г. Шибаєв.
З 2015 р кафедра працює над темою науково-дослідної роботи «Організація транспортного процесу та управління роботою флоту на ринку міжнародного судноплавства». За результатами роботи над темою видана колективна монографія.
Сьогодні на кафедрі «Експлуатація флоту і технологія морських перевезень» ведеться науково-дослідна робота аспірантів та здобувачів наукового ступеня кандидата наук (Ph.D).
У 2016-17 навчальному році на кафедрі виконані і успішно захищені в Спеціалізованому вченій раді ОНМУ дисертація на здобуття наукового ступеня доктора технічних наук Е. В. Кирилової «Теоретичні основи управління роботом флоту у транспортно-технологічних системах» і кандидатська дисертація Д. О. Вишневського «Методичні основи организации роботи універсальніх суден на міжнародніх лініях », підготовлені до захисту дисертації Мелешенко К. С., Берневек Т. І., Вишневської О. Д.
Наукова школа «Функціонування та розвиток транспортних процесів у системі морських та річкових перевезень» була затверджена наказом ректора ОНМУ № 332-орг від 13.10.2021 р.
Наукова школа «Функціонування та розвиток транспортних процесів у системі морських та річкових перевезень» має достатньо довгу історію, що створило підґрунтя для її формальної організації у 2021 році. Перші спроби наукового розв’язання задач в галузі морських і річкових транспортних процесів відносяться до початку 1930-х років і нерозривно пов’язані із науковцями Одеського національного морського університету. Організація та управління роботою суден – це напрямок наукових досліджень, який створювали і розвивали засновники даної наукової школи – Бакаєв В.Г., Сухоцький В.І., Воєвудський Є.М., Панарін П.Я., Лапкін О.І., Шибаєв О.Г.
У процесі розвитку школи її добутки збагачувались науковими результатами, які пов’язані не тільки з експлуатацією флоту, а також з більш широким поглядом на роботу суден – як елементів транспортно-технологічних, логістичних систем, систем доставки вантажів.
Сучасні дослідження, які проводять представники школи та їх аспіранти / докторанти, відповідають вимогам часу та враховують глобальні тренди - забезпечення безпеки судноплавства, гнучкість та адаптивність процесів транспортування вантажів, забезпечення екологічності морського перевезення та інш.
Під керівництвом представників школи - Шибаєва О.Г., Онищенко С.П. за останні роки було захищено 3 докторських та 10 кандидатських дисертацій.
Очолює наукову школу Онищенко Світлана Петрівна, доктор економічних наук, професор, член-кореспондент Транспортної академії України.
Сьогодні у складі школи 5 докторів наук, 3 з них працюють на кафедрі, – Шибаєв О.Г., Онищенко С.П., Коскіна Ю.О. та активно приймають участь у підготовки Phd здобувачів на спеціальністю 275 Транспортні технології (на морському та річковому транспорті).
Чотири представники наукової школи приймають участь в атестації здобувачів ступеня доктора технічних наук за спеціальністю 05.22.01 – Транспортні системи в докторській спеціалізованій вченій раді Д 41.060.01 при Одеському національному морському університеті.
Представники наукової школи:
д.т.н., проф. Шибаєв О.Г.
д.е.н., проф. Онищенко С.П.
д.т.н., проф. Коскіна Ю.О.
к.т.н., доц. Дрожжин О.Л.
к.т.н., доц. Вишневський Д.О.
к.т.н., доц. Вишневська О.Д.
к.т.н., доц. Щербина О.В.
к.е.н., доц. Судник Н.В.
к.т.н., доц. Кравченко О.А.
к.т.н., доц. Боровик С.С.
к.е.н., доц. Михайлова Ю.В.
к.е.н., доц. Сильванська Г.М.
к.т.н., Берневек Т.І.
Стеба А.А.
Тихоніна І.І.
Вільшанюк М.С.
