Одеський національний морський університет відомий у всьому світі як флагман підготовки багатьох поколінь фахівців морського транспорту, як престижний багатопрофільний навчальний заклад, зі стін якого щорічно виходять фахівці найвищого класу, як для України так і для зарубіжних країн. На сьогоднішній день, на 7 факультетах університету навчається понад 5 тис. студентів за 11 спеціальностями. Поряд з цим, не менш важливою складовою частиною Одеського Національного Морського Університету є науково-дослідний сектор. Тільки за перші 10 років його існування було виконано більше 1000 досліджень і розробок, значна частина яких була опублікована у вигляді монографій, наукових статей і впроваджувалася у виробництво. Велика робота велася за договорами з Міністерством Морського Флоту, пароплавствами, портами і судноремонтними заводами. За роки існування науково-дослідного сектора постійно розширювався спектр напрямків, кількість та обсяги науково-дослідних робіт.

У 2002 році в структурі університету був створений НДІ фундаментальних і прикладних досліджень у сучасному його вигляді. Тут працюють наукові кадри вищої кваліфікації, науковий потенціал яких, а це 30 докторів наук і понад 160 кандидатів, дозволяє вести наукову роботу на найвищому рівні.

Наукові дослідження, які виконуються вченими університету, щорічно публікуються в наукових збірниках, в т.ч. і міжнародних виданнях (у середньому, на рік понад 350 наукових статей, більше 20 монографій, понад 10 підручників).

За роки існування НДІ науковцями університету досягнуті чималі успіхи. Захищено 18 докторських і 96 кандидатських дисертацій. За пріоритетними напрямками виконано фундаментальних досліджень на суму 2 млн.472 тис.грн, прикладних досліджень і розробок на 2 млн.340 тис.грн. Виконано господарських робіт на замовлення підприємств морегосподарського комплексу на 4 млн.244 тис.грн.

Кафедрами університету постійно виконується наукова робота в межах робочого часу. Результати наукових розробок систематично впроваджуються в морську галузь і в навчальний процес. Кращі студенти щорічно беруть участь у всеукраїнському конкурсі наукових робіт, в студентських семінарах, займаючи призові місця. Чимало випускників ОНМУ успішно пройшли через аспірантуру і поповнили професорсько-викладацький склад.

За останні 10 років були подані 594 заявки на винаходи, отримано 48 патентів на винаходи, з яких 27 впроваджено у виробництво.

Поряд з цим, в ОНМУ створено 6 навчально-наукових та 13 науково-дослідних лабораторій.

Університет постійно співпрацює з Південним Науковим центром НАНУ (ПНЦ НАНУ) та Інститутом проблем ринку та економіко-екологічних досліджень НАН України (ІПРіЕЕД НАНУ).

В інституті ПРіЕЕД функціонує філія кафедри "Економіка підприємства і підприємництво на морському транспорті", де студенти та аспіранти університету закріплюють отримані теоретичні положення на сучасному фактичному матеріалі під керівництвом досвідчених фахівців.

Найважливіші результати наукової та науково-технічної діяльності вчених ОНМУ розміщуються в щорічному збірнику "НАУКА в Південному регіоні України".

У 2010 році укладено договір про співпрацю з Інститутом відновлюваної енергетики Національної Академії наук України.

Більшість професорів університету є членами Транспортної академії наук України.

Науково-дослідна та науково-практична діяльність НДІ сконцентрована за пріоритетними напрямками, в першу чергу, пов'язаними з невідкладними потребами морегосподарського комплексу, енергозбереження та екології, а також вирішенням завдань в галузі морської транспортної політики України. Зокрема, ОНМУ брав участь у розробці таких державних програм, як "Танкерний флот", "Національна програма розвитку морського і річкового транспорту України до 2005 року", "Кодекс торговельного мореплавства". Крім того, в НДІ розроблені проекти, які стали вирішальними у галузі морського і річкового транспорту України: "Концепція державної морської політики України", "Стратегія розвитку морської та річкової підгалузей України до 2001 року" та ін.